not far from 100% と、almost 100%、の意味上の違い。 を英語に訳すと？

おっしゃる通りだと思います。

Something is not far from 100%. というと、100％を照準として、そこには至っていない、というニュアンスがあると思います。
The success rate was less than (but not far from) 100%.

Something is almost 100%. というと、100％を照準として、ほぼそこに至っている、というニュアンスがあると思います。
The success rate was almost 100%.