この文章の意味を教えてください

おそらく、この文章の前に、質問者さんが会話の相手に何か答えたのだと推測いたします。
それに対して、相手の方が「それが僕の質問の意図じゃないよ」と言っている内容だと思います。

No, how long it took for 〇〇km one day?
「違うよ。一日で〇〇km（移動するのに）どれくらいの時間がかかった？」

チャットか何かで文章が少し端折られているのと、断定形で疑問文になっているようです。
推測なので、間違っているかもしれませんが、以下が伝えたかった文章かな、と思います。
“No, I meant how long it took for you to travel 〇〇km on one day.”
「違うよ。一日のうちに〇〇km移動するのにどれくらいの時間がかかったのか、ということを言いたかったんだよ」

以上、少しでもご参考になれば幸いです！