三単現のSとは

ご存知かと思いますが、三単現とは「三人称、単数、現在」の略です。主語が三人称かつ単数であり、時制が現在の場合には動詞に-sや-esをつけなければなりません。あくまで参照するのは主語が単数かどうかです。Kenji plays many sports.の文では主語はKenjiで単数ですので、このままで正しいと考えられます。目的語（この場合many sports）が複数か単数かは動詞にsをつけるかどうかに一切関与しません。