日本語が上手ですね。は英語でどう言うの？

まず、外国人であるということは日本語が上手ではない、日本語を話せないという憶測はあまり良くないので、気をつけましょう。
相手が日本語を勉強をしていることを言っていた場合など、褒めても失礼でないいときに以下の表現を使いましょう。

★Your Japanese is very good.
（あなたの日本語はとても上手ですね）

・one’s 言語 is good.
その人がある言語を話すのが上手、という意味です。

【例】
Wow, your Japanese is very good. You sound like a native speaker.
（おお、日本語がお上手ですね。ネイティブみたいですね）

★Your Japanese sounds very natural.
（あなたの日本語はとても自然に聞こえます）
上手／下手ではなく、自然な日本語に聞こえるよ、と褒める表現です。

【例】
Your Japanese sounds very natural. Be more confident.
（あなたの日本語はとても自然に聞こえますよ。もっと自信を持って）