I　had　been　disliking の意味は？

ここではhad大過去とさせて頂くと、まずhadを使うにあたって基準となる時間が無いんです。
もし、嫌いだったとおっしゃりたいのであれば、いつから嫌いだったか、などの時間の軸が必要なんです。例文等にもおそらくsinceなどで表していると思います。その他にも文節で表していることもあります。
日本人には、嫌いだったとも読み取れなくはないですが、こいつ分かってないな...ってネイティブに思われると思います。意味は伝わると思います！