In ,before、after使い方

正しいのは、
He came back after two weeks. です。この場合、２週間はすでに過ぎた時間ということになりますので、過去のことを述べる he came back と合わせて使えます。

before two weeks というと、この場合は来たるべき２週間、ということになりますので、まだ過ぎていない時間の前に起こることを過去のことを述べる he came back と合わせては使うと意味がおかしくなります。（現在や未来の自制では使えます。）He came back before his two weeks vacation. であれば意味が通ります。それは、his two weeks vacation がすでに過ぎたものとして表現されているからです。

in two weeks というと、この場合は２週間という期間の間に、ということになりますので、過去の１時点を述べる he came back と合わせて使うと意味がおかしくなります。（完了形では使えます。）