aの有無、及び""の位置について
In the early days of the automobile, many people did not think very highly of it. Farmers did not like it because it frightened their horses. They called it a "devil wagon."
最後の英文についてですが、
devil wagonが普通名詞ならば、They called it "a devil wagon."と
devil wagonが固有名詞ならば、They called it "devil wagon."とすべきではないですか？
ご教授の程よろしくお願いします。
回答
wagon は可算名詞なので、a devil wagon か、devil wagons かのどちらかの表記をすることになります。
この文脈では、複数の wagons ではなくて、たまたま見かけたひとつの a wagon について a devil wagon と農民たち（farmers）が呼ぶことについて言っているので、they called it a "devil wagon." となっています。
ここで "a devil wagon" ではなく a "devil wagon" としているのは、devil うんぬんという名称について注意を引きたいわけで、それが a か複数かということは重要なことではないので、クォーテーションから外している、ということです。
仮に devil wagon が固有名詞であれば、最初の文字を大文字にして、Devil Wagon と表記されていたことでしょう。しかしその場合でも、wagon が可算名詞であることに変わりはないので、a "Devil Wagon" となっていたでしょう。