by the skin of one's teeth のイメージ

旧約聖書のヨブ記をヘブライ語から英語に翻訳する際に起きた誤訳から発生しているらしいです。ヨブの病気についての記述です。ヨブ記は紀元前の書物ですし、初めて英語に訳されたのは約400年前です。

現代の英語のイディオムは、それとは異なる意味合いで使われています。ですので、英語を学習する上で「何でこう言うのか」を知ることに、あまり価値はありません。このまま覚えてしまいましょう。

雑学として知っていてもいいかも知れませんが、ヘブライ語の話になってしまうので、控えます。