熱エネルギーは鉱物を有用な物質に変換します を英語に訳すと？

"transform"と"convert"の違いは一言でまとめるのは難しいのですが、ご質問のケースで考えますと、"transform"は「劇的な変化」を意味するのに対して"convert"は「科学的な変化」ではあるものの「劇的な変化」ではないという違いがあります。
したがってご質問のような内容では"convert"とする方がよろしいでしょう。