なぜwasではないのか。

Manchester United はイングランドのサッカーチームですから、
サッカー選手の集合体とみて、team と同じように集合名詞と解釈します。
集合名詞は複数形扱いされることがあるので、動詞が was ではなく were になります。

集合名詞の例としては他に family, team, company, people, police などがあります。
常に単数または複数扱いの語もあれば、単数扱いと複数扱いの両方になれる語もあり、
意外とルールがややこしいです。ここでは詳しい説明は割愛させていただきますが、
お手元の参考書やインターネットなどで「集合名詞」を調べてみるといいかと思います。