違い

rewrite は、もう一度書き直す、という意味で、
overwrite は、今書いてあるところに上書きする、という意味です。

結果として今書いてあることを変える、という意味で似ていますが、
日本語で言うところの「書き直す」と「上書きする」と同じ違いがあります。