if の必要性

I don't know whether you can just change it or if you need to make a whole new one.

この whether は if と同じ意味で使われているので、if は不要です。
I don't know if you can just change it or if you need to make a whole new one.
ということも可能です。

I don't know... と言っている後の〜かどうかということが2つあるので、それぞれの節について whether や if をつけることになりますが、口語的には whether A or B ということで
I don't know whether you can just change it or you need to make a whole new one.
という人もいると思います。